Tiene como misión fundamental asistir al Comandante en Jefe en ejercicio de su comando, planificando, coordinando y evaluando las actividades operativas, logísticas y administrativas.

• Asesorar al Comandante en políticas y objetivos de la Fuerza Aérea en el mediano y largo plazo
  
  
• Elaborar el Plan Estratégico de la Fuerza Aérea, coordinando con los Comandos Aéreos, su instrumentación y ejecución
  
  
• Asesorar en la elaboración de los proyectos del articulado para la Ley de Presupuesto Nacional, así como al correspondiente Plan Quinquenal de la Fuerza Aérea
  
  
• Elaborar y actualizar la planificación de la actividad anual de la Fuerza Aérea
  
  
• Procesar la información estadística necesaria para la toma de decisiones del Comandante en Jefe

• Jefatura que comprende:

Ayudantía

Secretaría


• Sub Jefatura para Personal (A-1)
  
  
• Sub Jefatura para Inteligencia (A-2)
  
  
• Sub Jefatura para operaciones (A-3)
  
  
• Jefatura para Logística (A-4)
  
  
• Sub Jefatura para Comunicaciones e Informática (A-5)
  
  
• Sub Jefatura para Planeamiento y Presupuesto (A-6)
  
  
• Centro Coordinador de Operaciones de Mantenimiento de la Paz (CE.CO.MA.PA)
  
  
• Transporte Aéreo Militar Uruguayo (T.A.M.U.)
  
  
• Oficina de Enlace